SSRF生物大分子晶体学线站结构解析数突破1000

2014/07/01 | 【 【打印】【关闭】 | 访问次数:

SSRF生物大分子晶体学线站(BL17U1)是一条设计用于高分辨和高通量生物大分子晶体结构解析的线站。自20095月开放运行以来,每年向用户供光超过4000小时。目前已有近200个课题组利用BL17U1线站开展了实验,发表SCI论文超过500篇,其中发表在NatureScienceCell上的论文32篇。 

蛋白质结构数据库(Protein Data Bank,简称PDB)是一个专门收录蛋白质及核酸的三维结构资料的数据库。科学家在发表包含了新解析的生物大分子结构的学术论文之前都需要将结构提交给PDB数据库,并公开给全世界的研究人员免费使用。同时,为了保证科学家在提交了结构数据后有充足的时间完成论文投稿与发表工作,防止竞争对手抢投,PDB数据库允许已提交的结构数据最长保密一年。也就是说,第一年底提交的结构数据,有可能会延至第二年底才正式公布。 

目前全世界共有130多条生物大分子晶体学线站在运行中。从国际网站(http://biosync.sbkb.org/)可以检索到国际各蛋白质晶体学线站从19952012年完整的结构解析情况,以及20132014年的部分情况。从已公开的数据来看,自20095月对用户开放以来,用户利用BL17U1线站解析并公开发表的晶体结构数已突破1000。此前国际上共有20个线站结构解析数累计超过1000个,其中NSLS X29A线站突破1000个结构所用的时间最少为7年。考虑到PDB数据的延时公开,SSRF生物大分子晶体学线站实现这一突破的时间仅约为四年半,创下了国际同类线站实现这一突破新的纪录。此外,2012年度BL17U1解析蛋白质晶体结构数为333个,排名世界第一。从目前已公布的2013年度部分数据来看,BL17U1线站解析结构已达306个,继续领先世界,远高于暂列第二位的NSLS X29A 解析的239个结构。目前,单条线站年度解析结构数的世界纪录为347个,于2010年由APS 19ID线站获得。从往年公布的结构解析数随月度的增加趋势来预测,预期BL17U1将很快打破这一历史纪录。 

上海光源生物大分子晶体学线站以国际同类线站最快的速度实现了最高的产出,这首先归因于我国急速增长的高水平结构生物学用户群体,也充分说明了BL17U1线站的高性能和高效率运行。 

Deposition Year 

Asia 

AUSTRALIAN 

BSRF 

NSRRC 

PAL/PLS 

PHOTON FACTORY 

SAGA-LS 

SPRING-8 

SSRF 

1998 

43 

0 

0 

0 

0 

43 

0 

0 

0 

1999 

76 

0 

0 

0 

0 

59 

0 

17 

0 

2000 

137 

0 

0 

0 

0 

71 

0 

66 

0 

2001 

150 

0 

0 

1 

2 

79 

0 

69 

0 

2002 

220 

0 

0 

5 

14 

63 

0 

143 

0 

2003 

393 

0 

9 

8 

23 

96 

0 

261 

0 

2004 

443 

0 

12 

10 

14 

117 

0 

295 

0 

2005 

599 

0 

21 

8 

28 

175 

0 

377 

0 

2006 

608 

0 

15 

18 

37 

179 

0 

370 

0 

2007 

871 

1 

13 

44 

55 

209 

0 

554 

0 

2008 

580 

10 

29 

47 

65 

215 

0 

220 

0 

2009 

805 

69 

20 

63 

106 

258 

0 

299 

8 

2010 

911 

76 

27 

96 

81 

280 

0 

260 

112 

2011 

1057 

139 

18 

92 

66 

267 

0 

282 

204 

2012 

1307 

157 

28 

99 

60 

357 

1 

291 

333 

2013 

1276 

243 

17 

107 

81 

293 

0 

239 

306 

2014 

156 

34 

2 

15 

13 

33 

0 

20 

40 

Total 

9719 

729 

211 

613 

645 

2881 

1 

3763 

1003 

线站数 

32 

2 

2 

3 

3 

8 

1 

12 

1 

  SSRF生物大分子晶体学线站蛋白质结构解析数统计 

  (数据引自 http://biosync.sbkb.org 国际网站统计截止2014-06-24) 

    

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